Высокоточное предсказание структуры белка для протеома человека

Высокоточноепредсказаниеструктурыбелкадляпротеомачеловека

Аннотация

Белковые структуры могут предоставить неоценимую информацию, как для рассуждений о биологических процессах, так и для проведения таких вмешательств, как разработка лекарств на основе структуры или направленный мутагенез. После десятилетий усилий 021% из общие остатки в последовательностях белков человека покрываются экспериментально определенной структурой 1 . Здесь мы значительно расширяем структурный охват, применяя современный метод машинного обучения AlphaFold 2 в масштабе почти для всего протеома человека. (2021. 5% белков человека). Результирующий набор данных охватывает % остатков с уверенным прогнозом, из которых подмножество (42% всех остатков) имеют очень высокую достоверность. Мы представляем несколько показателей, разработанных на основе модели AlphaFold, и используем их для интерпретации набора данных, определяя сильные многодоменные прогнозы, а также регионы, которые могут быть неупорядоченными. Наконец, мы приводим некоторые тематические исследования, иллюстрирующие, как высококачественные прогнозы могут использоваться для создания биологических гипотез. Важно отметить, что мы делаем наши прогнозы бесплатно доступными для сообщества через общедоступную базу данных (размещенную в Европейском институте биоинформатики по адресу https://alphafold.ebi.ac.uk/ ). Мы ожидаем, что обычное крупномасштабное и высокоточное предсказание структуры станет важным инструментом, позволяющим решать новые вопросы со структурной точки зрения.

Информация об авторе

Заметки автора

      Эти авторы внесли одинаковый вклад: Джон Джампер, Демис Хассабис

      Принадлежности

      1. DeepMind, Лондон , Великобритания

        Кэтрин Туньясувунакул, Йонас Адлер, Захари Ву, Тим Грин, Михал Зелински, Огюстин Жидек, Алекс Бриджланд, Эндрю Коуи, Клеменс Мейер, Агата Лейдон, Ричард Эванс, Александр Прицель, Майкл Фигурнов, Олаф Роннебергер, Расс Бейтс, Саймон А.А. Коль, Анна Потапенко, Эндрю Дж. Баллард, Бернардино Ромера-Паредес, Станислав Николов, Ришуб Джейн, Эллен Клэнси, Дэвид Рейман, Стиг Петерсен, Эндрю В. Старший, Корай Кавукчуоглу, Пушмит Кохли, Джон Джампер и Демис Хассабис

      2. Европейская лаборатория молекулярной биологии, Европейский институт биоинформатики, Хинкстон, Великобритания

        Самир Веланкар, Джерард Дж. Клейвегт, Алекс Бейтман и Эван Бирни

      Авторы для переписки

      Переписка на Кэтрин Туньясувунакул или Джон Джампер или Демис Хассабис .

Дополнительная информация

Об этой статье

Verify currency and authenticity via CrossMark

Verify currency and authenticity via CrossMark Цитируйте эту статью

Tunyasuvunakool, K., Adler, J., Wu, Z. и другие .

Высокоточное предсказание структуры белка для протеома человека. Природа (03828). https://doi.org/17. 2021 / с – 36 – – 1

Скачать цитату

  • Получили

  • :

  • Принято:

  • 021 Июль 03828